Table 1 Primers used in this study
Primers | Nucleic acid sequence |
|---|---|
[Amplification of cnb1 cassette] | |
2000 bp | |
Fcnb1(2000 bp) | CCGTGATCTGCTGCACGTTCGGGTCCG |
Rcnb1(2000 bp) | CTGTTCACCTCTGGCTACGACCCCCTCCTC |
1500 bp | |
Fcnb1(1500 bp) | ACGAGCCTTGCGCTGGGCCTCCT |
Rcnb1(1500 bp) | GCTCCTGCCGGTGGCTACGAGCAGCC |
1000 bp | |
Fcnb1(1000 bp) | CATTGCCGCCAACCTTGAGTGCTCGGAGC |
Rcnb1(1000 bp) | GCCGCGCCCCCGCCAGCCGGGAAAC |
500 bp | |
Fcnb1(500 bp) | CGCGCCGCGCTGTCCCATCGCTATTACAC |
Rcnb1(500 bp) | CATACCCGCCCCTTTCCTATGTGACTGATACC |
250 bp | |
Fcnb1(250 bp) | CTGCGTTGGAGGACACGTCTACTCGCCATGA |
Rcnb1(250 bp) | ACATGTCATGATGTTCATGGAAGGGGAAGAG |
[Joint PCR] | |
cnb1(5ʹUTR) | |
Fcnb1(5ʹUTR) | ACGAGCCTTGCGCTGGGCCTCCT |
Rcnb1(5ʹUTR)(NAT1 inf) | AGCTCACATCCTCGCAGCGCAGTGCAATCTTGGTCAGTCGGTCGTGGCC |
cnb1(3ʹUTR) | |
Fcnb1(3ʹUTR)(NAT1 inf) | TAGTTTCTACATCTCTTCGCGCGCACACACGGATGTGAGCGTAACGAG |
Rcnb1(3ʹUTR) | GCTCCTGCCGGTGGCTACGAGCAGCC |
NAT1 | |
FNAT1(5ʹUTR inf) | TGACCAAGATTGCACTGCGCTGCGAGGATGTGAGCTGGAGAGC |
RNAT1(3ʹUTR inf) | ACATCCGTGTGTGCGCGCGAAGAGATGTAGAAACTAGCTTCCTGGTTTC |
cnb1(5ʹUTR)-NAT1 | |
Fcnb1(5ʹUTR) | ACGAGCCTTGCGCTGGGCCTCCT |
RNAT1(3ʹUTR inf) | ACATCCGTGTGTGCGCGCGAAGAGATGTAGAAACTAGCTTCCTGGTTTC |
NAT1- cnb1(3ʹUTR) | |
FNAT1(5ʹUTR inf) | TGACCAAGATTGCACTGCGCTGCGAGGATGTGAGCTGGAGAGC |
Rcnb1(3ʹUTR) | GCTCCTGCCGGTGGCTACGAGCAGCC |
cnb1(5ʹUTR)-NAT1-cnb1(3ʹUTR) | |
Fcnb1(5ʹUTR) | ACGAGCCTTGCGCTGGGCCTCCT |
Rcnb1(3ʹUTR) | GCTCCTGCCGGTGGCTACGAGCAGCC |
[Genotyping] | |
Primers-1 for cnb1 genotyping | |
F cnb1 gene locus | GGAGTGAAGAAGGGCAGAGAGCAACAACAGCGGT |
R cnb1 gene locus | CCGTGATCGCATGGGGCGTGCACAAAGTG |
Primers-2 for cnb1 genotyping | |
F cnb1 gene ORF | CGGCTCGGGTACGGTAGACTTCCAGGAGTTTGTCG |
R cnb1 gene ORF | AACAGGTCCTCGAGCGTCATCTGCTTGACGATGT |