From: Genetic characterization of extraintestinal Escherichia coli isolates from chicken, cow and swine
Antimicrobial | AR gene | E433 | E497 | E535 | E565 | E80 | E533 | E175 | E2 | E386 | E461 | E543 | E393 | E418 | E530 | E30 | E205 | E100 | E34 | E122 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aminoglycoside | aac(3)-IIa | + | + | |||||||||||||||||
aac(3)-IId | + | + | + | |||||||||||||||||
aac(3)-IVa | + | + | + | |||||||||||||||||
aac(6’)Ib-cr | + | + | ||||||||||||||||||
aadA1 | + | + | + | + | + | |||||||||||||||
aadA16 | + | |||||||||||||||||||
aadA2 | + | + | ||||||||||||||||||
aadA5 | + | + | ||||||||||||||||||
aadB | + | |||||||||||||||||||
aph(3′)-Ia | + | |||||||||||||||||||
aph(3′)-IIa | + | + | + | |||||||||||||||||
aph(4)-Ia | + | + | + | |||||||||||||||||
rmtB | + | + | + | |||||||||||||||||
strA | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||
strB | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||
Beta-lactam | blaCMY-2 | + | + | |||||||||||||||||
blaCTX-M-3 | + | |||||||||||||||||||
blaCTX-M-14 | + | |||||||||||||||||||
blaCTX-M-55 | + | + | ||||||||||||||||||
blaCTX-M-65 | + | + | ||||||||||||||||||
blaCTX-M-125 | + | |||||||||||||||||||
blaOXA-1 | + | + | ||||||||||||||||||
blaTEM-1B | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||
Colistin | mcr-1 | + | ||||||||||||||||||
Fluoroquinolone | aac(6′)Ib-cr | + | + | |||||||||||||||||
oqxA | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||
oqxB | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||
qepA | + | + | ||||||||||||||||||
Fosfomycin | fosA | + | + | + | ||||||||||||||||
Macrolide, Lincosamide, Streptogramin B | mph(A) | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||
erm(B) | + | + | ||||||||||||||||||
Phenicol | catA1 | + | + | + | + | |||||||||||||||
catB3 | + | + | ||||||||||||||||||
cmlA1 | + | |||||||||||||||||||
floR | + | + | + | + | + | + | ||||||||||||||
Rifampicin | ARR-3 | + | + | + | ||||||||||||||||
Sulphonamide | sul1 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | ||||||||||
sul2 | + | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||
Tetracycline | tet(A) | + | + | + | + | + | + | + | + | |||||||||||
tet(B) | + | + | + | + | + | |||||||||||||||
tet(M) | + | |||||||||||||||||||
Trimethoprim | dfrA1 | + | + | + | + | + | + | |||||||||||||
dfrA12 | + | + | ||||||||||||||||||
dfrA17 | + | + | + | + | ||||||||||||||||
dfrA27 | + | |||||||||||||||||||
Number of predicted resistance antimicrobial class | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 3 | 5 | 6 | 6 | 6 | 7 | 7 | 7 | 8 | 8 | 9 | 9 | 9 |