From: Genetic characterization of extraintestinal Escherichia coli isolates from chicken, cow and swine
Antimicrobial | AR gene | E433 | E497 | E535 | E565 | E80 | E533 | E175 | E2 | E386 | E461 | E543 | E393 | E418 | E530 | E30 | E205 | E100 | E34 | E122 |
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Aminoglycoside | aac(3)-IIa | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | + | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
aac(3)-IId | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | + | + | Â | Â | |
aac(3)-IVa | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | + | |
aac(6’)Ib-cr |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | + | + | |
aadA1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | + | + | + | Â | Â | + | Â | Â | Â | Â | |
aadA16 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | |
aadA2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | + | |
aadA5 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | Â | Â | |
aadB | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | |
aph(3′)-Ia |  |  |  |  |  |  |  |  | + |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |
aph(3′)-IIa |  |  |  |  |  |  |  |  |  | + |  |  |  |  | + |  | + |  |  | |
aph(4)-Ia | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | + | |
rmtB | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | Â | + | Â | |
strA | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | + | + | + | Â | + | Â | + | + | Â | + | + | |
strB | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | + | + | + | Â | + | + | + | + | + | + | + | |
Beta-lactam | blaCMY-2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
blaCTX-M-3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | Â | Â | |
blaCTX-M-14 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | |
blaCTX-M-55 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | |
blaCTX-M-65 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | + | |
blaCTX-M-125 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | Â | |
blaOXA-1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | |
blaTEM-1B | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | + | + | Â | + | + | + | + | + | + | + | |
Colistin | mcr-1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + |
Fluoroquinolone | aac(6′)Ib-cr |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | + | + |
oqxA | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | + | Â | Â | + | + | Â | + | Â | Â | + | + | |
oqxB | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | + | Â | Â | + | + | Â | + | Â | Â | + | + | |
qepA | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | + | |
Fosfomycin | fosA | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | Â | + | Â | Â |
Macrolide, Lincosamide, Streptogramin B | mph(A) | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | + | Â | + | + | Â | + | + | Â |
erm(B) | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | Â | Â | |
Phenicol | catA1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | + | Â | + | Â | Â | + | Â | Â | Â |
catB3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | |
cmlA1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | |
floR | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | + | Â | Â | + | Â | + | + | + | |
Rifampicin | ARR-3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | + |
Sulphonamide | sul1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | + | + | + | Â | + | + | Â | + | + | + |
sul2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | + | + | + | + | Â | + | + | Â | + | + | |
Tetracycline | tet(A) | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | + | Â | + | + | + | Â | + | Â | Â | + | Â | + |
tet(B) | Â | Â | Â | Â | + | + | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | + | Â | + | Â | |
tet(M) | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | |
Trimethoprim | dfrA1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | + | + | + | Â | Â | + | Â | Â | + | Â |
dfrA12 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | + | |
dfrA17 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | Â | + | + | Â | + | Â | Â | Â | |
dfrA27 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | + | Â | Â | |
Number of predicted resistance antimicrobial class | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 3 | 5 | 6 | 6 | 6 | 7 | 7 | 7 | 8 | 8 | 9 | 9 | 9 |