Table 2 Phenotypic and molecular characteristics of clinical isolates
From: Molecular identification of nontuberculous mycobacteria using the rpoB, argH and cya genes analysis
Isolates no | rpoB sequencing | Phenotypic tests | Growth rate | Pigment production | MacConkey agar* | Urease production | Iron uptake | Arylsulfatase (3 days) | 68 °C catalase | Nitrate reduction | Niacin production | Tellurite reduction | Tween80 hydrolysis |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
11 | M. fortuitum | M. fortuitum like | R | N |  +  |  +  |  +  |  +  |  +  |  +  | − |  +  |  +  |
4 | M. fortuitum | M. chelonae | R | N |  +  |  +  |  +  |  +  |  +  | − | − |  +  |  +  |
1 | M. farcinogenes | M. fortuitum like | R | N |  +  |  +  |  +  |  +  |  +  |  +  | − |  +  | − |
2 | M. simiae | M. scrofulaceum | S | Y/Sc | − | − | − |  +  |  +  | − | − |  +  | − |
2 | M. thermoresistibile | M. gordonae | S | Y/Sc |  +  |  +  |  +  | − | − |  +  | − |  +  |  +  |
6 | M. abscessus | M. chelonae | R | N |  +  |  +  |  +  | − |  +  | − | − |  +  | − |
5 | M. simiae | M. simiae | S | Y/P | − | − | − | − |  +  | − |  +  |  +  | − |
9 | M. kansasii | M. kansasii like | S | Y/P | − |  +  | − | − |  +  |  +  | − |  +  |  +  |
3 | M. yangoense or M. chimerae | M. avium complex | S | N |  +  | − | − | − | − | − | − |  +  | − |
5 | M. yangoense or M. chimerae | M. avium complex | S | N |  +  | − | − | − |  +  | − | − |  +  | − |
2 | M. elephantis | Mycobacterium sp. | S | Y/P | − |  +  | − |  +  |  +  |  +  | − |  +  |  +  |
3 | M. kansasii | Mycobacterium sp. | S | Y/Sc | − |  +  | − | − |  +  |  +  | − | − |  +  |
4 | M. abscessus | Mycobacterium sp. | R | N |  +  |  +  |  +  | − | − | − | − |  +  | − |
4 | M. abscessus | Mycobacterium sp. | R | N |  +  |  +  |  +  |  +  | − | − | − |  +  | − |
1 | M. chelonae | M. chelonae | R | N |  +  |  +  |  +  |  +  |  +  | − | − |  +  |  +  |
1 | M. intracellulare | M. avium complex | S | N |  +  | − | − | − |  +  | − | − |  +  | − |
1 | M. gordonae | M. gordonae | S | Y/Sc |  +  |  +  |  +  | − | − |  +  | − |  +  |  +  |